Το εργαστήρι παραδοσιακών μουσικών οργάνων (βιολιού και λαούτου) του Συνδέσμου λειτούργησε από το 1979 στην Πατριωτική Στέγη με σκοπό τη διάσωση της ζώσας πλούσιας θερμιώτικης μουσικής παράδοσης. Όλοι οι αναγνωρισμένοι σήμερα θερμιώτες οργανοπαίχτες ξεκίνησαν από το εργαστήρι αυτό. Σήμερα το εργαστήρι συνεχίζει την παράδοση της «παραγωγής» νέων μουσικών.